1775. gada 14. augustā ar Krievijas ķeizarienes Katrīnas II dekrētu Zaporožje Siha beidzot tika likvidēta. Pēc ievērojamas Mazās Krievijas daļas atkalapvienošanās ar Krievijas valsti 1654. gadā privilēģijas tika paplašinātas Zaporožjes armijai, ko baudīja citi Krievijas kazaku karaspēki. Svarīga loma bija Zaporožjes kazakiem. Kazaki aizstāvēja Krievijas dienvidu robežas, spēlēja ievērojamu lomu karos ar Krimas hanātu un Osmaņu impēriju. Tāpēc kazaki saglabāja zināmu autonomiju no centrālās valdības. Tomēr kazaki pasargāja bēgļus, kas slēpās Zaporožje Sičā, no cariskās varas vajāšanas. Turklāt draudēja sacelšanās pret centru - aliansi ar Krievijas ārējiem ienaidniekiem.
Tātad, 1709. gadā koshevoy ataman Kost Gordienko un hetman Mazepa parakstīja sabiedroto līgumu ar Zviedrijas karali Charles XII. Zaporožje Sich pievienojās Mazepas un Kārļa aliansei pret Krieviju. Notika vairākas sadursmes starp kazakiem un Krievijas karaspēku. Pēteris dod pavēli princim Menšikovam pārvietot trīs pulkus no Kijevas uz Siču pulkveža Jakovļeva vadībā, lai "iznīcinātu visu nemiernieku ligzdu". Sičs tika iznīcināts, un vēlāk Pēteris neļāva to atjaunot. Kazaki dibinājās uz zemēm, kuras kontrolēja turki un Krimas tatāri, Kamenskaja (1709-1711) un Aleshkovskaya Sich (1711-1734). Tomēr tie nebija ilgi.
1733. gadā, kad pēc kara sākšanās starp Krievijas impēriju un Turciju Krimas hans pavēlēja Alioškovskajas Sičas kazakiem doties uz Krievijas robežu, ģenerālis Veisbahs (tolaik viņš nodarbojās ar Ukrainas celtniecību) cietokšņu līnija) pasniedza kazakiem sertifikātu Krasnijas Kuta traktātā, 4 verstus no vecās Čertomlytskajas Sičas. Kazaki saņēma vēstuli no ķeizarienes Annas Ioannovnas par apžēlošanu un pieņemšanu Krievijas pilsonībā. Rezultātā tika izveidots Jaunais (Podpolnenskaya jeb Pidpilnyanskaya) Sich, tas pastāvēja līdz Zaporožje Sihas galīgajai iznīcināšanai 1775. gadā.
Jaunais Sičs ļoti atšķīrās no vecā. Viņa kļuva ne tikai par militāru, bet arī par ekonomisku, politisku organismu. Kazaki saņēma pilnīgu pašpārvaldi un zemes apmetnei. Parādījās jaunas struktūras - "palankas". Tās bija sava veida Sičas "provinces" Samārā, Miusā, Bugā, Inguletos u.c. Katrā palankā valdīja pulkvedis, Ēzuls un ierēdnis, kas bija pakļauti Košai. Tieši zeme kļuva par kazaku galveno ienākumu avotu, nevis algu. Apmetušos Sičas "ziemasčaku" apkārtnē - precējušies kazaki, viņiem nebija nedz balsstiesību parlamentā, nedz tiesības tikt ievēlētiem amatā un viņiem bija pienākums samaksāt "dūmus" Sičas kasē, tas ir, ģimenes nodokļa veids. Papildus precētiem kazakiem sāka saukt citplanētiešus (galvenokārt zemniekus, nabadzīgus cilvēkus, kuri meklēja labāku dzīvi), kuri nāca no Lielās Krievijas guberņām, Ukrainas labā krasta un turku īpašumiem. Viņi netika uzskatīti par kazakiem, bet bija Sičas pavalstnieki, piegādāja pārtiku un maksāja 1 rubli gadā. Sičas iedzīvotāji dzīvoja ar zveju, medībām, lopkopību, lauksaimniecību un tirdzniecību. Meistars saņēma ienākumus no nodevām par preču importu, īpašumtiesībām uz zemi, ganībām, zveju.
Kazaki paklausīja tikai saviem likumiem, sīkumos viņi tika tiesāti palanketēs, nozīmīgās lietās - koševojā. Likumpārkāpēju varēja nodot impērijas varas iestādēm, taču visbiežāk viņi paši tika sodīti līdz pat nāvessodam. Sich ātri kļuva par vienu no plaukstošajiem Krievijas reģioniem. Palanketes klāja ciemati un saimniecības.
Tomēr Sičā bija arī nopietnas pretrunas starp darbu vadītāju un golotu. Tātad cara valdība gandrīz nekavējoties pārkāpa pienākumu ik gadu izmaksāt Sich 20 tūkstošus rubļu algu. Jau 1738. gadā viņi sāka dot tikai 4-7 tūkstošus. Pārējo naudu lika samaksāt no armijas līdzekļiem, bet tie bija tukši. Tā rezultātā varas iestādes sāka krāpties - viņi "publiski" izdalīja 4 tūkstošus rubļu, pārējā nauda tika slepeni nodota meistariem, kurenu priekšniekiem. Tomēr kazaki par to ātri uzzināja: 1739. gadā koševojs Tukals un vecākie gāza, sita un izlaupīja savu īpašumu (koševojs bija tik smagi piekauts, ka drīz nomira). Nākotnē meistari turpināja kļūt bagāti. Jo īpaši koshevoy Kalnyshevsky savulaik pārdeva 14 tūkstošus zirgu no saviem ganāmpulkiem. Parastie kazaki bija nabadzībā, visi labumi gāja priekšnieka labā.
Parastie kazaki strādāja priekšniekam, makšķerēja, un attīstījās arī "gaidamastvo", tas ir, laupīšana. Bugas lejtecē saplūda Krievijas, Turcijas un Polijas robežas, kas palīdzēja slēpties pēc laupīšanas. 1750. un 1760. gados Gaidamache kļuva par īstu katastrofu šajā reģionā. Cilvēki vienkārši baidījās ceļot pa Bug reģionu. Sūdzības par kazakiem plūda no Turcijas un Polijas. Imperiālās varas norādījumi vienkārši bija "nolaisti uz bremzēm". Tirdzniecība bija ļoti ienesīga, un daudzi meistari un palanku administrācija bija daļa. Kad 1760. gadā Krievijas varas iestāžu spiediena ietekmē Koševojs Belēckis organizēja reidu, lai notvertu laupītājus, tikai 40 cilvēkus izdevās arestēt. Un pat tad kuren atamans aizliedza tos izsniegt, izjauca kurenos un pēc grēku nožēlas atbrīvoja. Kad Krievijas militārā pavēlniecība izveidoja patrulēšanu pie robežas ar regulāru kavalēriju un piepilsētas kazakiem, sākās bruņotas sadursmes.
Radās vēl viens konflikta iemesls starp Siču un centrālo valdību. Šajā periodā aktīvi attīstījās iepriekš tukšās Savvaļas lauka teritorijas un kazaki sāka aizstāvēt savas "likumīgās" zemes. Viņi savus apgalvojumus pamatoja ar viltojumu - "kopiju no Stefana Batorija vēstules", kurš viņiem it kā deva zemi netālu no Čigirinas pilsētas, gar Samaru un Dienvidu Bugu, Dņepras kreiso krastu līdz Severska Donetai. Un tā kā Krievijas suverēni, sākot ar Alekseju Mihailoviču, apstiprināja "bijušās Zaporožjes brīvības", pats vārds "brīvības" sāka interpretēt teritoriālā nozīmē. Zaporožjas kazaki, aizstāvot savas "likumīgās" zemes, neapstājās pie spēka pielietošanas. Viņi nodedzināja vairākas jaunas apmetnes, izklīdināja ciema iedzīvotājus. Tā rezultātā kazaki vienkārši kļuva nekaunīgi, izaicinot centrālo valdību. Tomēr Elizabetes un Hetmana Razumovsku vadībā viņi tika galā.
Katrīnas II laikā situācija mainījās. Viņa nopietni pievērsās brīvās Ukrainas lietām. 1763. gadā etmans Razumovskis, kurš deva mājienu par sava amata iedzimtību, atkāpās no amata "pēc savas gribas". Mazā krievu kolēģija tika atjaunota. Par tās prezidentu tika iecelts ģenerālis P. A. Rumjantsevs. Viņš atrada pilnīgas sabrukuma ainu Ukrainā. Militārā elite, kas valdīja Razumovska vārdā, pilnībā izkrita no rokām. Meistari pārvērtās par visvareniem muižniekiem, īstiem vietējiem "prinčiem". Viņi nonāca līdz tam, ka cīnījās savā starpā, izaicināja zemi, apbruņoja kazakus un zemniekus. Iedzīvotāji tika pakļauti nežēlīgai ekspluatācijai. Parastie kazaki bankrotēja, pārvēršoties par lauku strādniekiem, vai arī nodarbojās ar personīgo lauksaimniecību. 1721. gada dekrēts par kazaku destilācijas veicināšanu negatīvi ietekmēja karaspēku. Daudzi cilvēki dzēra sevi līdz nāvei, citi dzēra savus zemes gabalus. Tā rezultātā mazā krievu armija sadalījās. Rumjancevs pat nevarēja noorganizēt pasta nodaļu: bagātie negribēja kalpot, nabagiem nebija iespēju.
Bija jāveic pasākumi, lai atjaunotu vietējo karaspēku kaujas spējas.1764. gadā viņi sāka pārveidot kazaku vienības par parastajām. No Ukrainas pulkiem tika izveidoti 5 husāri: melni, dzelteni, zili, serbi un ugorski. Turklāt tika izveidoti četri pikinersku pulki (Elisavetgradsky, Dneprovsky, Doņeckas un Lugansky). Vēlāk tika izveidoti vēl vairāki husāru pulki un Landmilitia tika reorganizēta par kājnieku vienībām. Kopumā Ukrainai bija jāzaudē savs īpašais statuss un jāizlīdzinās ar citām Krievijas provincēm. Sēdēt šajos plānos bija nopietns šķērslis.
Uzmanība tika pievērsta arī "valstij valstī" - Zaporožje Sičai. 1764. gadā Košs bija pakļauts Mazajai krievu kolēģijai. Zaporožjes administrācija tika atzīta par to, ka vēlēšanas vairs netiek rīkotas. Kazaki bija sašutuši un pretēji norādījumiem rīkoja jaunas vēlēšanas, ievēlot Kalniševski par koševski. Jaunais koševojs bez atļaujas devās uz Sanktpēterburgu, lai pieprasītu ārvalstu kolēģijas tiešu pakļautību un aktualizētu jautājumu par "legālajām" Zaporožjes zemēm. Rumjancevs ierosināja ķeizarienei arestēt delegātus. Tika izstrādāts Sičas reformas projekts. Tomēr Katrīna neveica stingrus pasākumus, tuvojās jauns karš ar Turciju, viņi nevēlējās sarežģīt situāciju dienvidos. Ķeizariene laipni uzņēma delegāciju. Tas iedvesmoja kazakus, atgriežoties Sičā, viņi sāka lielīties, ka ir “nobiedējuši” valdību.
1767. gadā tika saņemts denonsējums, ka Koševojs Kalniševskis un lietvedis Ivans Globa piekrīt sākt sarunas ar Turcijas sultānu, ja valdība nepildīs viņu prasības. Katrīna atstāja denonsēšanu bez sekām, bet Siča liktenis jau bija iepriekš izlemts. Problēmas risinājums tika atlikts tikai līdz kara beigām ar Osmaņu impēriju.
Pati Sich vadība pasliktināja savu nestabilo stāvokli. Tas ne tikai izaicināja Krievijas varas iestādes, bet arī sazinājās ar Krimu un Turciju. Kara priekšvakarā kazaki saņēma vēstules no Bakhchisarai un Stambulas, kurās viņus vilināja iespēja pārcelties uz dienestu Turcijā, solot trīskāršu algu. Sicāna vārdā sultānu apmeklēja franču emisārs Totlebens. Kalniševskis atteicās turkiem, bet nepārtrauca saraksti. Turklāt viņš ļāva Totlebenam runāt ar kazakiem un nenodeva viņu Rumjancevam. Kazaku masas vidū sākās apjukums. Kad 1768. gada decembrī kazakiem tika uzdots sākt karu ar Turciju, viņi sacēlās. Kalniševskim vajadzēja ne tikai apspiest sacelšanos, bet lūgt palīdzību no Krievijas garnizona no Novosechensky atkāpšanās. Nemieri turpinājās vairākus mēnešus, kazaki atstāja robežas, un tatāri 1769. gada janvārī ielauzās Ukrainā.
Krievijas un Turcijas karā 1768.-1774. Piedalījās 10 tūkstoši kazaku (vēl aptuveni 4 tūkstoši palika Sičas teritorijā). Karā viņi parādīja augstas kaujas īpašības, izcēlās izlūkošanā un reidos, un viņiem bija svarīga loma Largas un Kahulas cīņās. Uzvara šajā karā bija vēl viens iemesls Zaporožjes armijas likvidēšanai. Noslēdzot Kučuk-Kainardzhiyskiy līgumu, Krievijas impērija ieguva piekļuvi Melnajai jūrai, tika izveidota Dņepras aizsardzības līnija, Krimas Hanāts atradās uz iznīcības robežas. Otrs vēsturiskais Krievijas ienaidnieks katoļu Polija zaudēja savu varu, un 1772. gadā notika tās pirmā sadalīšana. Zaporožjes kazaki zaudēja dienvidu robežu aizstāvju lomu.
1775. gada maijā ģenerāļa Pētera Tekeli korpuss tika pārvietots uz Siču. Operācija bija bez asinīm. Vecākie, saprotot, ka pretoties nav jēgas, kopā ar priesteriem nomierināja ierindas kazakus. Ar Katrīnas dekrētu Zaporožje Siha tika atcelta. Parastie kazaki netika vajāti. Daži palika Ukrainā un apmetās ciemos un pilsētās. Daži komandieri saņēma virsnieku pakāpes, priekšnieki kļuva par muižniekiem. Tikai trīs kazaki - Kalniševskis, militārais tiesnesis Pāvels Golovatijs un ierēdnis Globa tika notiesāti par nodevību un tika izsūtīti uz klosteriem. Kalniševskis dzīvoja Solovetskas klosterī līdz 112 gadu vecumam un nomira 1803. gadā, iegūstot klostera cieņu.
Daļa kazaku devās uz Donavu Turcijas sultāna pakļautībā un tika izveidota Transdanubijas Siha. 1828. gadā Trans-Donavas kazaki pārgāja Krievijas armijas pusē un cars Nikolajs I. viņus personīgi apžēloja. No viņiem tika izveidota Azovas kazaku armija. Krievijā kara laikā ar Turciju Aleksandrs Suvorovs 1787.-1788. no bijušās Sičas kazakiem un viņu pēcnācējiem viņš organizēja "lojālo zaporožiešu armiju". 1790. gadā tā tika pārveidota par Melnās jūras kazaku armiju un pēc tam saņēma Kubanas kreisā krasta teritoriju. Kazaki aktīvi piedalījās Kaukāza karā un citos Krievijas impērijas karos.
